S razvojem znanosti i tehnologije, mikrobiološki instrumenti postupno zamjenjuju ručne operacije, posebice u automatiziranoj hemokulturi, automatiziranoj identifikaciji bakterija i analizi osjetljivosti na lijekove, gdje su postignuti pomaci. Međutim, trenutno ne mogu u potpunosti zamijeniti ručne operacije. Ovisno o tome jesu li potrebni izolacija i kultura, dijele se na automatizirane sustave kulture i sustave ne-kulture.
Automatizirani sustavi kulture: sustavi automatizirane kulture dalje se dijele u dvije glavne kategorije prema njihovim funkcijama: automatizirani sustavi za otkrivanje i analizu hemokulture i automatizirani sustavi za identifikaciju mikroba i analizu osjetljivosti na lijekove.
Automatizirani sustavi za otkrivanje i analizu hemokultura: Automatizirani sustavi za otkrivanje i analizu hemokultura prvenstveno otkrivaju prisutnost mikroorganizama u uzorcima krvi. Tijekom procesa uzgoja, računalni sustav detekcije i analize automatski skenira bočice s kulturama proizvedene posebnim postupcima. Putem kontinuiranog-kvalitativnog praćenja u stvarnom vremenu tijekom 24 sata, ako dođe do promjena u mikrobnom rastu i metabolizmu, instrument automatski alarmira kako bi ukazao na prisutnost patogena.
Automatizirana mikrobna identifikacija i sustavi analize osjetljivosti na lijekove: Obično je nakon što se sumnjive bakterije izoliraju iz uzorka ručnom kulturom potrebna ručna identifikacija i testiranje mikroorganizama na lijekove. Ovaj proces nije samo dugotrajan-i složen, već je i podložan mnogim čimbenicima utjecaja. Automatizirana identifikacija mikroba i sustavi za testiranje osjetljivosti na lijekove zamjenjuju ručni rad u automatiziranoj detekciji i analizi. Identifikacija mikroba i analiza osjetljivosti na lijekove provode se istovremeno. Na principima digitalne bioinformatičke identifikacije formira se jedinstveni identifikacijski sustav. Istovremeno se provodi automatizirana analiza osjetljivosti na lijek koristeći difuziju diska ili metode razrjeđivanja mikro-bujona, čime se maksimalno štedi vrijeme, smanjuju ručne operacije, poboljšava radna učinkovitost i osigurava točnost rezultata ispitivanja.
Ne{0}}sustavi kulture odnose se na sustave koji ne zahtijevaju kulturu patogena. Usredotočeni su na brzo i dinamično otkrivanje specifičnih biomarkera, staničnih komponenti ili metabolita u patogenim mikroorganizmima. Njima se neizravno postiže brza etiološka dijagnoza pomoću biokemijskih, imunoloških i molekularno bioloških tehnika. Primarni instrument koji se koristi je brzi mikrobni analizator.
Detekcija biomarkera: otkrivanjem biomarkera bakterijske infekcije može se razlikovati infekcija od ne{0}}infekcije, težina bolesti može se dinamički procijeniti i može se voditi racionalna upotreba antimikrobnih lijekova. Ključni pokazatelji uključuju prokalcitonin, C-reaktivni protein i interleukine, koji se obično otkrivaju metodama imunološkog ispitivanja.
Otkrivanje komponente patogena: Bolesnici sa zaraznim bolestima često imaju visoku temperaturu, prvenstveno povezanu sa komponentama samog patogena. Otkrivanje komponenti samih patogena pomaže u dijagnozi bakterijskih ili gljivičnih infekcija. Obično se koriste biokemijske ili imunološke metode. Za bakterijske endotoksine mogu se koristiti tehnike kao što su gel elektroforeza, kolorimetrija i kemiluminiscencija; za 1,3- -D-glukan u stjenkama stanica gljivica mogu se koristiti metode kao što je analiza G faktora Limulus Amebocyte Lysate (LAL), ELSA i imunoturbidimetrija; a za galaktomanan u staničnoj stijenci gljivica mogu se koristiti metode kao što su lateks aglutinacija, radioimunotest i enzimski imunotest.
Molekularno biološka detekcija komponenti nukleinske kiseline omogućuje izravnu ekstrakciju DNA ili RNA iz uzorka, bez razmatranja bioloških karakteristika samog patogena. Identifikacija patogena postiže se analizom njegovih specifičnih sekvenci nukleinskih kiselina. Tehnike detekcije uglavnom uključuju pojačanje gena, 16S rRNA, identifikaciju nukleinske kiseline i proteomiku, a sve to obećava brzo otkrivanje patogena.
Automatizirani sustavi hemokulture i automatizirana mikrobna identifikacija i sustavi za testiranje osjetljivosti na lijekove dva su glavna analitička sustava u mikrobnom testiranju. Automatizirani sustavi hemokulture koriste se za otkrivanje prisutnosti patogena u uzorcima; automatizirani sustavi za identifikaciju mikroba i testiranje osjetljivosti na lijekove mogu identificirati izolirane patogene i provesti in vitro testove osjetljivosti na lijekove. Osim toga, naširoko se koriste instrumenti za brzo otkrivanje mikroba koji koriste metode ne-kulture.
